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Questo studio definisce un interactoma sistematico del complesso SET1C nel lievito, rivelando nuove connessioni funzionali con processi di regolazione cromatinica, biogenesi dell'RNA e trasporto nucleocitoplasmatico, e identificando una specifica metilazione arginina-dipendente del rimodellatore Snf2.
Lo studio rivela che l'interazione tra la topoisomerasi IIβ e la DNA-PK regola l'espressione dei geni indotti dall'ipossia modificando la topologia del DNA, dove la DNA-PK fosforila la TOP2β per reprimere la trascrizione in condizioni normossiche e favorirne il rilascio durante l'ipossia.
Questo studio dimostra come il bias di conferma nei metodi di selezione delle particelle per la criomicroscopia elettronica possa generare strutture molecolari spurie a partire dal rumore, evidenziando la necessità di strategie di mitigazione per evitare interpretazioni errate dei dati.
Lo studio rivela che i recettori di riconoscimento dei pattern batterici, in particolare le famiglie STAND NTPasi, difendono contro i batteriofagi rilevando un'ampia gamma di proteine core del fago, come la proteina del capside maggiore e gli enzimi replicativi, spesso sfruttando fattori ospiti come EF-Tu per potenziare la risposta immunitaria.
Questo studio rivela che il nucleosoma non è un semplice ostacolo passivo, ma agisce come una piattaforma dinamica che stimola l'attività della DNA polimerasi β nel DNA linker e coordina la scelta tra i sottopercorsi di riparazione per escissione di basi (BER) attraverso una complessa regolazione dipendente da PARP1/2 e dall'istone H1.
Questo studio rivela che l'RNA non codificante FENDRR agisce in un ciclo di feedback negativo per modulare finemente i livelli proteici del fattore di trascrizione FOXF1, regolando così la transizione dei fibroblasti in miofibroblasti e lo sviluppo polmonare embrionale, con implicazioni per la comprensione della displasia alveolo-capillare (ACDMPV).
Questo studio dimostra che l'ingegneria multi-obiettivo della monossigenasi di trimetilammina può migliorare la thermostabilità e ripristinare parzialmente l'attività con il cofattore NADH, sebbene il mantenimento simultaneo di una robusta funzionalità con NADH in condizioni termiche rimanga una sfida significativa.
Questo studio dimostra che farmaci riproposti, in particolare inibitori delle metalloproteinasi e delle fosfolipasi, neutralizzano efficacemente una vasta gamma di veleni del genere *Bothrops*, suggerendo il loro potenziale come interventi precoci per il trattamento dei morsi di serpente nelle Neotropici.
Questo studio presenta lo sviluppo e la validazione di un saggio RT-QuIC adattato per rilevare l'insulina misfolded, fornendo una prova di concetto per un nuovo strumento di indagine sul ruolo dell'aggregazione dell'insulina nella progressione delle malattie metaboliche e nell'invecchiamento.
Lo studio identifica METTL7B come un regolatore chiave del metabolismo lipidico e della progressione tumorale nel cancro pancreatico, dimostrando che la sua sovraespressione, guidata dai fattori di trascrizione HNF4A e HNF4G, favorisce l'accumulo di lipidi e la malignità, rendendolo un potenziale bersaglio terapeutico.
Utilizzando l'editing genomico CRISPR/Cas9, lo studio dimostra che la modifica del modulo regolatorio conservato TaIPA1-TaTB1 nel grano esaploide ne ottimizza l'architettura vegetale, aumentando significativamente il numero di culmi e il peso dei chicchi senza compromettere il numero di spighette.
Questo articolo propone l'uso della PCR digitale a goccia multiplex (ddPCR) e l'adattamento di un modello Poisson-multinomial per caratterizzare ad alto rendimento l'integrità dei vettori per la terapia genica, fornendo anche una valutazione dei limiti e delle migliori pratiche.
Il documento presenta Protenix-v2, un sistema avanzato per la previsione strutturale e la progettazione biomolecolare che supera le prestazioni della versione precedente con successi significativi nella scoperta di anticorpi, inclusi target GPCR difficili, e nella progettazione di leganti e mini-leganti per il SARS-CoV-2, accelerando così la scoperta di farmaci.
Gli autori descrivono un metodo che sfrutta l'attività di riempimento dei gap e di ligazione dell'RNA-templato della Bst DNA polimerasi per rilevare mutazioni espresse tramite sequenziamento mirato, consentendo l'analisi simultanea del trascrittoma completo e del profilo delle mutazioni in singole cellule.
Questo studio utilizza la criomicroscopia elettronica per dimostrare che lo stress del reticolo endoplasmatico nel lievito *S. cerevisiae* induce un'espansione dell'organello e un aumento dei ribosomi 80S inattivi, fornendo prove di una moderata inibizione della traduzione come meccanismo di risposta allo stress.
Questo studio dimostra che i dati della criomicroscopia elettronica codificano un paesaggio conformazionale latente fisicamente fondato e sperimentalmente azionabile, che può essere sfruttato per migliorare la ricostruzione strutturale, scoprire nuovi stati intermedi e interpretare la dinamica delle proteine.
Lo studio dimostra che la repressione epigenetica neuronale specifica di Cdk5, ottenuta tramite editing CRISPR/dCas9-HDAC3, compromette la memoria dipendente dall'ippocampo in entrambi i sessi, rivelando un meccanismo di regolazione trascrizionale condiviso che collega l'acetilazione istonica, il fattore di trascrizione CREB1 e l'attività di Cdk5.
Questo studio integra profili trascrizionali e spaziali di fibroblasti polmonari umani per identificare le cellule CTHRC1+ come hub di segnalazione fibrogenici nell'IPF, rivelando al contempo come le colture *in vitro* alterino significativamente l'identità cellulare nativa e la diversità dei sottotipi fibroblastici.
Lo studio dimostra che la proteina ribosomiale RPL38 regola l'omeostasi della subunità 60S, influenzando la stringenza del codone di inizio e la selezione della cornice di lettura durante la traduzione RAN patologica associata a C9ORF72.
Lo studio dimostra che la progettazione razionale di coniugati oligonucleotide-ligando, ottimizzando lunghezza, composizione del backbone e complementarità di sequenza, permette di superare la sfida della selettività nel riconoscimento e nella stabilizzazione di specifici quadruplessi di guanina (G4) attraverso un meccanismo di riconoscimento duale cooperativo.